Не успел отправить протокол разногласий - шли технические работы. Как быть в данной ситуации?

Обосновать контролирующему органу подтверждение данной ситуации возможно только в случае документального подтверждения отсутствия своевременной возможности размещения. В случае возникновения тех ошибок необходимо сделать скриншоты, отражающие саму ошибку, адрес в браузере, время и дату. Напомню, что срок давности нарушений такого рода 1 год + не факт, что будет проверка именно по данному факту.