Можно ли отклонить вторую часть заявки (электронный аукцион по 44-ФЗ) если не указан ИНН учредителя?

Обратите внимание на судебную практику:
1. ИНН у учредителя или руководителя отсутствует вообще: 
Неуказание участником закупки в составе второй части заявки сведений об идентификационном номере налогоплательщика учредителей при его отсутствии, само по себе не влечет признание такой заявки не соответствующей требованиям установленным документацией об аукционе (см. Определение Верховного Суда РФ от 09.06.2016 N 302-КГ16-6054 по делу N А74-3528/2015)
2. ИНН у учредителя или руководителя имеется:
Если в составе заявки содержалась информация об ИНН учредителя в форме сведений, указанных в копии выписки из Единого государственного реестра юридических лиц, то заявку отклонять нельзя (см. Постановление Арбитражного суда Уральского округа от 22.07.2016 N Ф09-7431/16 по делу N А71-70/2016). А так как копия выписки передается заказчику самой электронной площадкой, то внимательно посмотрите, есть ли там сведения об ИНН учредителя. Если они есть в выписке, но вы их не указали во 2 части заявки, то заявка все равно должна быть признана соответствующей.
Будьте особо внимательны, если хотите создать только видимость торгов - заказчик может прислать вам контракт на подпись.